Программный конвейер «MirCLL»


Программный конвейер MirCLL предназначен для выявления профиля экспрессии микро-РНК (миРНК) при хронической лимфоцитарной лейкемии (ХЛЛ) и определения роли миРНК в биологических путях, связанных с лейкемогенезом при ХЛЛ. Общая схема конвейера приведена на рисунке 1.

pic1

Рисунок 1. Блок схема программного конвейера MirCLL.

Входные данные для конвейера:

• Информация об уровнях экспрессии миРНК, измеренных в образцах костного мозга и лимфатических узлов пациентов с ХЛЛ и контрольной группы.

Выходные данные конвейера:

  1. Список миРНК, статистически значимо отличающихся по уровню экспрессии между группой пациентов с ХЛЛ и контрольной группой.

  2. Гены-мишени, кодирующие мРНК, с которыми взаимодействуют выявленные значимые миРНК.

  3. Перепредставленные биологические процессы, ассоциированные с найденными генами-мишенями миРНК.

Таким образом, конвейер mircll позволяет выявить молекулярные маркеры для диагностики ХЛЛ и определить роль миРНК в биологических путях, связанных с развитием данного заболевания.