Генная сеть регуляции биосинтеза холестерина

С помощью программно-информационной системы ANDSystem (https://ipcgn.cytogen.ru/databases/sysbio/andsystem) реконструирована генная сеть регуляции биосинтеза холестерина (рисунок Д ?). Сеть включает (1) гены SREBF1, SREBF2 и кодируемые ими белки; (2) пять белков, регулирующих активность факторов SREBP1 и SREBP2 (INSIG1 INSIG2, SCAP, MBTPS1/S1P MBTPS2/S2P), и кодирующие их гены («холестериновый сенсор»); (3) 62 белка-регулятора генов и белков «холестеринового сенсора»; (4) 31 ген-мишень факторов подсемейства SREBP (c учетом самого SREBF2) и кодируемые ими белки; (5) 243 взаимодействия между объектами. Средствами программы ANDVisio (часть ANDSystem) в сети выявлены замкнутые регуляторные контуры, контролирующие активность транскрипционных факторов подсемейства SREBP, которые реализуются с участием генов PPARG, NR0B2/SHP1, LPIN1, AR и кодируемых ими белков. Систематизированные в формате сети данные являются основой для исследования молекулярных механизмов развития заболеваний и особенностей эволюционирования сложных систем.

Рисунок 1. Генная сеть регуляции биосинтеза холестерина, визуализированная в программе ANDVisio. Эта программа отображает белки SREBP1 и SREBP2 как объекты с обозначениями SRBP1 и SRBP2.