Реконструированные генные сети человека и животных, контролирующие состояние тревожности

Модуль позволяет анализировать тексты научных публикаций для составления списка генов и реконструкции генных сетей, вовлеченный в регуляцию состояний тревожности у экспериментальных мышей и людей.

В качестве входных данных используются тексты научных статей на английском языке, содержащих описание результатов психогенетических экспериментов.

Обработка данных включает:

1. Составление списка генов, дифференциальная экспрессия которых достоверно различается у мышей с разным уровнем личностной тревожности;

2. Составление списка мозговых структур, в которых у мышей с разным уровнем тревожности наблюдается дифференциальная экспрессия генов;

3. Составление списка генов-ортологов человека, дифференциальная экспрессия которых связана с уровнем личностной тревожности;

4. Реконструкция и анализ генных сетей, вовлеченных в регуляцию тревожности у экспериментальных животных и человека.

Результатом работы программного модуля являются описания генных сетей, вовлеченных в регуляцию тревожности.

Рисунок 1. Визуализация потенциальной генной сети человека LAGn, ответственной за состояние низкой тревожности у человека. Римскими числами обозначены изолированные кластеры. Арабскими числами обозначены: 1 - Ген, 2 - Белок, 3 - Подавление активности белка, 4 - Повышение активности белка, 5 - Каталитическая реакция, 6 - Экспрессия, 7 - Подавление экспрессии гена, 8 - Регуляция экспрессии гена, 9 - Повышение экспрессии гена, 10 - Белок-белок взаимодействие.

Рисунок 2. Визуализация потенциальной генной сети человека HAGn, ответственной за состояние высокой тревожности у человека. Обозначения аналогичны представленным на рисунке 1.