ГС ренин-ангиотензин-альдостероновой системы (РААС) человека
ВВЕДЕНИЕ. Анализ РААС на молекулярно-генетическом уровне является одним из приоритетных направлений в исследованиях патогенеза артериальной гипертонии и других сердечно-сосудистых заболеваний, чем и определяется актуальность проведённой работы. МЕТОДЫ. Реконструкцию и анализ ассоциативной генной сети РААС, описывающей молекулярно-генетические взаимодействия между генами и белками, поиск замкнутых регуляторных контуров, анализ на основе критериев центральности и степени близости осуществляли с помощью графической интерфейс-программы ANDVisio, которая является программным обеспечением информационной системы ANDSystem. Также были проанализированы регуляторные контуры в генных сетях с помощью инструмента Pathway Wizard из пакета программ ANDSystem. Мы реконструировали ассоциативную генную сеть РААС для 145 генов, в которой отражены связи с кодируемыми белками, а также с транскрипционными факторами, которые регулируют экспрессию генов РААС. ОПИСАНИЕ ГЕННОЙ СЕТИ. На основании списка из 145 генов, связанных по литературным данным с РААС, а также списка непосредственных участников РААС была реконструирована ассоциативная генная сеть, включающая в себя 145 генов, столько же белков и обогащенная такими взаимодействиями (1457), как регуляция активности, катализа, расщепления, деградации, транспорта белков и экспрессии генов. На рисунке Ж.15 представлена генная сеть РААС, расширенная взаимодействиями между компонентами сети и включающая отрицательную и положительную регуляции активности и деградации, катализ, распад, транспортную регуляцию.
Рисунок Ж.15 Ассоциативная генная сеть РААС, расширенная взаимодействиями между компонентами сети и включающая отрицательную и положительную регуляции активности и деградации, катализ, распад, транспортную регуляцию
На рисунке Ж.16 показаны регуляторные контуры, регулирующие экспрессию генов и белков генной сети РААС. Рисунок Ж.17 демонстрирует регуляторные взаимодействия между генами «ядра» РААС и ассоциированных с РААС генами. На рисунке Ж.18 представлены механизмы транскрипционной регуляции генной сети РААС.
Рисунок Ж.16 Регуляторные контуры взаимодействия регуляции экспрессии генов и белков генной сети РААС
Рисунок Ж.17 Регуляторные контуры в сети посредников между генами «ядра» РААС и ассоциированных с РААС генами
Рисунок Ж.18 Регуляторные контуры в сети посредников между генами транскрипционных факторов РААС и ассоциированных с РААС генами
ПУБЛИКАЦИЯ. Vishnevsky O., Kuzminykh K., Yatsyk I., Kondratyuk E., Chadaeva I. Transcription factors in the associative gene network of the renin-angiotensin-aldosterone system in humans. Gene Expression. 2025. 25(1):e00050. DOI: 10.14218/GE.2025.00050