Транскрипционный каскад (этилен)

Транскрипционный каскад, инициируемый этиленом у Arabidopsis thaliana, реконструирован автоматически на основании анализа транскриптомных данных ответа на этилен из открытых источников (Zhang et al., 2016) с использованием средств веб-сервера CisCross (Lavrekha et al., 2022). Вершины графа представляют транскрипционные факторы (ТФ). ТФ1 и ТФ2 соединены дугой, направленной от ТФ1 (регулятор) к ТФ2 (мишень), если ТФ1 связывается с 5’ регуляторным районом гена, кодирующего ТФ2. Тип дуги (стрелка или линия с поперечной планкой) определяется функцией ТФ-регулятора (активатор или репрессор транскрипции, соответственно). Цветовая кодировка вершин графа отражает тип транскрипционного фактора в следующих терминах: белые буквы на красном фоне – подавляемый активатор; белые буквы на голубом фоне – подавляемый репрессор; черные буквы на красном фоне – активируемый активатор; черные буквы на голубом фоне – активируемый репрессор.